SUR LES FONCTIONNALITES EPIGENETIQUES DE L'HYPODERMINE DU VARRON (*)

Joël Sternheimer

Réseau associatif de chercheurs indépendants ,

1 rue Descartes 75005 Paris

Le varron est un parasite des bovins dont les larves percent le cuir, et dont l'Administration a ordonné l'éradication en 1994 (1). Cependant une forte corrélation a été observée en Angleterre entre cette éradication et l'apparition quelques années après de l'encéphalite spongiforme bovine (2). Nous effectuons ci-après une recherche d'homologies de suites de fréquences (représentées par les chiffres de 0 à 9 dans le sens des fréquences croissantes) associées d'après (3) à la biosynthèse de l'enzyme responsable (hypodermine) parmi les protéines bovines (4), afin de préciser le rôle du parasite vis-à-vis de son hôte, tel qu'on peut le déduire de la caractérisation, par cette méthode, des différentes fonctionnalités épigénétiques de cette enzyme.


>> Séquence de l'hypodermine C (EC 3.4.21.49) du varron

444085183047385104443454588393002444459443116336413233384021
*******-*

358505133425844262574343844431445436358344453484320554445754

491332090524343344583844344448315583304435234304324052337042

00373424544440332732010352053307283328549455430457*
aaaaaaaaaaaaaaaaaaa~-~-~~~-



Homologues bovins de l'hypodermine du varron
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> recherche 444085

>> pancreatic secretory trypsin inhibitor - bovine

44408515334534033848433303403382453443554558533344552033*
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L'homologie la plus significative du thème de l'hypodermine C est avec l'aprotinine bovine ou PSTI, une protéine digestive, indiquant que c'est d'abord une mauvaise alimentation qui favorise le parasitage, et qu'inversement dans ce cas, l'hypodermine du parasite va favoriser une digestion plus "ferme" chez son hôte.



>> insulin-like growth factor-binding protein 3 precursor - bovine

548133849111431434480331181010350103338353341813153133332333

154384103033433148505330383583020483533304383451444080431412
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa******

130848384432120402525546250235451032368333257634635543455061

542588534852523435472252585358033885554344645744542380464343

455078555538325085807393345805343074350504363825525*

L'IGF-BP3 et une protéine stimulée par la sous-alimentation (5), indiquant que cette dernière, de même qu'une mauvaise alimentation, favorise le parasitage.



>> aromatase (EC.14.14.-) cytochrome P450 19 - bovine

544534438684332532533341241444430744439485432243032874040344

263874950402134884558057583933055344425222576355626842870254

045740565504474443149513837735142030438533431424356448455334
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa*

440834343458845443245474043445214335450874195144453447754294
****

385855235445415544455586842315545424471354471558054385434534

455441134352323775474415635355144854533305844844455545335474

452588533344358514544344083355034444440856845773534573454715
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa******

433888753707038131058435355533433448876353450833555555444246

34538484554733842453458*



>> alpha-lactalbumin precursor - bovine

552732444304476135155435353785454450800324359333376320843514
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa**-**--

354442358047544454935445436224434423457444443444533554445304

4894165143255445943554*

L'aromatase et la lactalbumine participent d'un métabolisme autour de la prolactine, indiquant qu'un manque de soins et d'affection en général va favoriser le parasitage.



> recherche 444080

(Note: les fréquences représentées par 0 et 5 ne diffèrent que d'une octave)

>> superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) (Cu-Zn) - bovine

135133345040335034675150433333024304350460763657044350332103

674342556003545586304404331454031434434344242058244083533655

3444080045523530410284130340415*
a******

L'homologie avec cette enzyme déficiente dans la sclérose latérale amyotrophique, indique qu'un défaut d'exercice (parcage dans des espaces réduits...) favorise également le parasitage.



>> NADH dehydrogenase (ubiquinone) (EC 1.6.5.3) precursor - bovine

54843385143042522503... ( + 500 aa )... 25311444085303514554
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa******

Une protéine respiratoire, dont l'implication comportementale renforce l'indication précédente.



> recherche 408518

>> desmocollin 2a precursor - bovine (fragment)

02383361444225522734442435355555443...(+315 aa)...5555334540

334513830328233451333343545450353438353384554333035340851843
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa******

530222048855224350934345420343445844851820384424412454083340...

Une protéine du cuir: un cuir en mauvaise santé, peu ferme, favorise déjà en soi le parasitage.



Anti-homologues bovins de l'hypodermine du varron
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(444085) => 555(9)24; (2...1-352) => 6...9-536

>> casein kinase II (EC 2.7.1.-) alpha' chain - bovine (fragment)

482445924035412547855377605448454384153403454808455864444367
aaa--****

444405628589547462548643235144444544884655843155155638783335

55253314413422043118*

En d'autres termes, en favorisant la caséine, le varron améliore le lait des vaches mal nourries.



>> major prion protein 2 precursor - bovine

535264029443473159243043558353000943002883050230048833500009
aaaaaaaaaaaaaaaa****

053600090536000905360009053600009050026259453253534556310111
aaa~---~-~~~---~-~~~---~-~~~

101330040085402152834467044854888854568834538883345824544736

433443355633333350547353445555833555343585852518858012344722

3334444274474430*

Ici la signification de l'anti-homologie du thème de l'hypodermine (****) est renforcée par une anti-homologie portant sur la partie répétitive du prion (~~~~): en d'autres termes, le varron exerce une inhibition relative sur le prion -- relative car chacune de ces anti-homologies est complétée par une homologie partielle à la signification environ deux ordres de grandeur plus faible (5924 suivi de 304 présent à la suite du thème lui-même, maintien du "bourdon" 0 dans l'anti-homologie avec la partie répétitive). Ceci signifie que la présence d'un nombre excessif de parasites -- de l'ordre de la centaine! -- serait susceptible d'inverser le sens de cette action inhibitrice, soulignant le rôle à la fois protecteur et avertisseur rempli par le parasite; et vient offrir une explication au moins partielle aux corrélations observées en Grande-Bretagne (2) entre l'éradication répétée du varron et l'apparition subséquente de l'encéphalite spongiforme bovine (ESB, maladie à prion): les vaches ayant mangé des farines carnées, mal nourries, étaient parasitées; le parasite apportant une relative mais significative protection contre l'ESB, son éradication a par contre, favorisé celle-ci...

Etant donnée notamment l'importance des effets de seuil dans le déclenchement de l'ESB, nous ne pouvons donc que recommander l'annulation de l'arrêté pris le 4 novembre 1994 par le Ministère de l'Agriculture, qui a ordonné l'éradication du varron.



>> major prion protein 1 precursor - bovine

535264029443473159243043558353000943002883050230048833500009
aaaaaaaaaaaaaaaa****

053600090536000905360009053600090536000090500360594532535345
aaa~---~-~~~---~-~~~---~-~~~---~-~~~

563101111013300400854021528344670248548888545688345388833458

245447364334433556333333505473534455558335553435858525188580

123447223334444274474430*

Même commentaire que ci-dessus.



>> 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (EC 3.1.4.17), cyclic GMP-st

588531128447155333302040145414424023443104551355142134353533

838444052843355336543550538513428584034040324430534184313413

435343434345510131134436305424455924513556343145835145585223...
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa*******



>> opioid-binding protein OPCAM precursor - bovine

503302475395343332484474333033382041373515443338505213483344

483383194482344810445924438344434333582454543438450383323534
aaaaaaaaaaaaaaaaaa*******

463532836443533354544224333450223344341408353333986423550507...

Une alimentation incluant des substances entraînant une dépendance, favorise encore le parasitage.



>> phospholipase A2 receptor precursor - bovine

534424244444453310215311913335848595450474452544553451252343

45435334585495932468... ( + 200 aa )... 56402513539504454454

109592483344844953544753735863037417535195284352343833558443
aaa****

346033554195881363530943648438545555539451452352442343443241

535743344045412539404226543327592402233734963453647348254332
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa****

15525069535435534784... ( + 200 aa )... 57016412716455547345

446257483558579407458434410295924033332274442870541843138514...
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa****


Concerne diverses inflammations dont peut souffrir le bétail, qui peuvent favoriser le parasitage, en incluant celles associées aux piqûres du parasite lui-même, qui peuvent favoriser son extension, et appellent ainsi à une maîtrise en tenant compte des différentes observations ci-dessus - ce à quoi le procédé décrit dans (3) peut naturellement contribuer de façon efficace (6).



Références:

(*) D'après deux conférences à Bruxelles et à Caen (20 et 21 avril 1999).

(1) Arrêté du 4 novembre 1994.

(2) M. Purdey, Medical Hypotheses vol.46, p.445, 1996.

(3) J. Sternheimer, "Procédé de régulation épigénétique de la biosynthèse des protéines par résonance d'échelle", brevet FR 92 06765.

(4) Atlas of protein and genomic sequences, PIR database (NBRF 1996).

(5) Je remercie le Dr. J. Gernez pour cette information.

(6) Cf. http://www.bekkoame.ne.jp/~dr.fuk/

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En haut: représentation d'un extrait de la séquence inhibitrice du prion correspondant à sa partie répétitive, suivant (3).

En bas: extrait de la séquence apte à stimuler l'hypodermine du varron, acides aminés 200 à 208.

On remarquera l'identité des fréquences entourées d'un trait pointillé, séparées par un "bourdon" à la fonction essentiellement rythmique, ce qui correspond à une probabilité de hasard inférieure à 1 pour mille (encore renforcée par la première homologie comme indiqué ci-dessus).

Ceci permet de conclure avec une haute probabilité à l'existence d'une inhibition épigénétique relative de la réplication du prion par la biosynthèse in situ de l'hypodermine du varron.



La corrélation observée en Angleterre entre l'éradication du varron et l'apparition de l'encéphalite spongiforme bovine, d'après la référence (2).

La corrélation entre ancienneté de l'éradication du varron et occurence de l'ESB en France, au 13 mai 2001. Les données sur les dates de début du traitement varron par département ont été réunies par Jean Coulardeau (Coordination nationale contre l'éradication du varron, pour une agriculture responsable, La Ribe, 43430 Vastres, France). L'optimisation de cette corrélation par l'emploi d'échelles logarithmiques (nombre de cas et durées) est caractéristique de la nature de l'interaction en cause telle qu'ici développée, confirmant le rôle protecteur du varron vis-à-vis de l'ESB. La diminution de la zone en rouge (Rhône) et l'augmentation de celle en vert (Bretagne) entre la carte du traitement varron et celle de l'ESB paraissent traduire un effet de seuil dû au passage d'une affection initialement sporadique à un caractère infectieux; l'hypothèse d'une origine multifactorielle de ce dernier (2) est soulignée par l'aspect légèrement plus dispersif observé pour la région bretonne. (Figure et Note ajoutées en mai 2001).

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